1. 提交審計報告
首先，稅務局會讓妳提交審計報告，這個報告妳要找會計師事務所來出，主要清算報告和所得稅匯算清繳的報告，這個報告分保留意見和無保留意見，如果是小企業的註銷，審計報告是無保留意見，沒有什麽大額的欠款、往來和存貨，壹般稅務局會不查帳就讓妳過了。
2. 查增值稅帳
主要看妳公司前期的增值稅申報是否正確，有沒有前期欠繳的增值稅，有沒有本期還沒有報的增值稅，增值稅發票是否完整，有沒有丟失。
3. 查存貨款
查看公司有沒有存貨帳，這些存貨要麽在註銷前銷售並開具增值稅發票，如果在查帳時還有存貨，那稅務局就會要求做進項稅額轉出，把之前存貨抵扣了的進項稅在帳務上進行轉出，並要在當期的增值稅申報表上體現。
4. 查往來帳
稅務局會查往來帳，特別是金額比較大的往來帳和欠款，有沒有往來的憑據，比如借款合同、打款的銀行回單等等，稅務局查這個主要是查妳有沒有隱瞞的收入或沒有開發票的收入。
5. 查所得稅
稅務局查所得稅主要查有沒有前期欠繳的所得稅，當期的所得稅有沒有繳；成本費用中有沒有白條入帳的，也就是沒有發票的費用入帳，沒有發票的費用入帳要在所得稅匯算清繳中調增；有沒有大額的營業外支出，這些營業外支出在稅務局備案沒有，有沒有稅務局備案和同意稅前扣除的材料，如果沒有，營業外支出要在所得稅匯算清繳中調增。
6. 地稅局查帳
地稅局查帳主要是查和地稅有關的帳，比如印花稅有沒有交，個人所得稅有沒有交，工會經費有沒有交，殘保金有沒有交等等。在註銷之前自己先清理下，該補繳的就補繳，查帳時應該沒什麽問題就通過了。
擴展資料：
公司註銷稅務如何查賬：
1、?現在的稅務局，壹般都要求先出註銷清算報告，匯算清繳報告，這些報告都是找事務所出的，上面會有保留意見或者無保留意見，正常來說國稅看妳沒有欠稅或者很大數額的不明賬款，都會讓妳註銷的了。
2、地稅相對比較麻煩，要查妳的註冊資本金印花稅有沒交，賬本印花稅之類的。把這些稅都補齊了，沒有什麽其他應收應付，無法解析的大額往來的話，基本上也會讓妳通過的了。如果有的話就要妳逐步補充解析材料，合情合理的壹般沒問題，解析不了的就按營收補稅，補完也就通過了。
3、壹般稅局專管員批復之前都會讓妳把電子賬，報表這些上傳到報稅的網站。大概也會瀏覽壹下每月報表，看看有沒有壹些很突兀的數字的。
參考鏈接：稅務查賬-百度百科