2.完善管理制度。會計電算化檔案的管理是重要的會計基礎工作。計算機替代手工記賬後，會計檔案增加了新的內容。因此，在電算檔案管理制度中，對電算化會計檔案的歸檔、保管、借閱、備份會計等都有相應的管理制度。各種紙質的會計檔案和介質的會計檔案要及時合理歸檔，做好記錄。歸檔的檔案做好防壓、防塵、防光、防腐蝕工作。 要建立嚴格的電算化會計檔案借閱制度， 借出、查看、歸還要做詳細記錄。
3.提高會計部門人員素質，完善人員配置結構。會計電算化，不僅需要壹定的專業會計人員，而且需要壹定的計算機人員參與維護日常使用和確保其數據的安全。所以必須不斷提高會計人員的計算機操作能力，同時需要有壹定數量的計算機高級人才管理與維護電算化會計軟件的正常使用、網絡的安全運行，不斷開發更合理、高效的電算化會計軟件。只有兩者***同配合，才能有效保證會計電算化的正常運行。
4.加強網絡安全管理。配備專業計算機管理人員。建立預防病毒和黑客的安全措施，加強對計算機病毒的預防、檢測以及殺毒工作，定期對系統安全性進行檢測，排除安全隱患，切實有效地保障計算機硬件與軟件系統的安全。
5.對所有的會計數據應進行雙備份。由於電算化會計檔案是存儲在磁性介質或光盤上的，根據這些信息載體的物理特性，在形成這些檔案時應實行“AB備份法”進行數據的備份。備份時要註明形成檔案的時間與操作員姓名，並貼上寫保護封簽，存放在兩個不同的地點，防止意外事故發生引起整個會計電算化系統的毀滅與系統的不可恢復性。檔案應保存在遠離磁場的位置，註意防磁、防火、防潮、防塵等。對采用磁性介質保存的檔案，還應定期進行檢查，定期進行復制，防止由於磁性介質的損壞，而使會計檔案丟失，造成無法挽救的損失。
總之，電算化會計檔案管理既是壹項重要的會計管理工作，又是壹項重要的檔案管理工作，各單位應依據電算化會計檔案形成的規律和特點，進壹步加強和改進管理方法，充分發揮網絡時代的會計檔案信息優勢，提高電算化會計檔案利用效率，為領導決策服務，逐步使電算化會計檔案走入正軌，真正使電算化會計檔案在會計工作中發揮出應有的作用。