1、工作在資格不同
會計人員必須要有會計從業資格證才可以工作，否則涉嫌違法執業。而秘書不需要資格證。
2、崗位性質不同
會計屬於會計崗位，秘書屬於壹般行政崗位
3、工作內容不同
會計人員主要工作是：制單、制證、跑銀行、辦貸款、記賬、算賬、對賬、查賬、出報表、報稅...
秘書主要工作是：查找資料、安排行程、安排會議、安排會客、轉接電話、訂餐館、訂賓館房間、寫文章。