壹是規範的對象不同；具體準則按經濟業務或項目，制度按壹個企業；
二是規範的重點不同：準則側重於確認和計量，制度側重於記錄和報告，確認和計量的內容有機地體現在會計科目及使用說明中。這樣，準則重點是規範會計決策的過程，而制度是重點規範會計的行為和結果。
具體差異如下：
會計科目
小企業會計準則
小企業會計制度
庫存現金（現金）
現金短缺或溢余通過“待處理財產損溢——待處理流動資產損溢”科目核算。
如為現金短缺，借記“管理費用”科目；如為現金溢余，貸記“營業外收入”科目。
銀行存款
未明確規範結算方式及匯兌損益的處理
明確規範結算方式及匯兌損益的處理
短期投資
持有期間所收到的股利、利息等，確認投資收益
持有期間所收到的股利、利息等，不確認投資收益，作為沖減投資成本處理
不計提短期投資減值準備
計提短期投資減值準備
應收票據
未規範票據利息的處理
規範票據利息的處理
因付款人無力支付票款，或到期不能收回應收票據的轉入“應收賬款”
應收票據不得計提壞賬準備，待到期不能收回轉入應收賬款後，再按規定計提壞賬準備。
應收賬款
未規範應收債權融資或出售應收債權的會計處理
規範應收債權融資或出售應收債權的會計處理
不計提壞賬，發生損失時直接轉銷計入“營業外收入”
計提壞賬準備，壞賬準備計入管理費用
原材料（材料）
未規範商品流通的小企業購入商品抵達倉庫前發生的包裝費、運雜費、保險費、裝卸費、運輸途中的合理損耗和入庫前的挑選整理費用等采購費用
商品流通的小企業購入商品抵達倉庫前發生的包裝費、運雜費、保險費、裝卸費、運輸途中的合理損耗和入庫前的挑選整理費用等采購費用直接計入當期營業費用
盤盈、盤虧或毀損的各種原材料通過“待處理財產損溢——待處理流動資產損溢”科目核算，待按照管理權限批準後計入營業外收入或營業外支出
盤盈的各種材料沖減管理費用；盤虧、毀損的各種材料計入營業外支出或管理費用
長期股權投資
成本法核算
分別采用成本法或權益法核算
固定資產
自行建造的固定資產的入賬價值由建造該固定資產決算前發生的支出（含相關借款費用）構成
自行建造的固定資產的入賬價值為達到預定可使用狀態前所發生的必要支出
無形資產
攤銷期自其可供使用時開始至停止使用或出售時止。有關法律規定或合同約定了使用年限的，可以按照規定或約定的使用年限分期攤銷。小企業不能可靠估計無形資產使用壽命的，攤銷期不短於10年。
攤銷年限應按合同受益年限、法律規定年限孰低確定，如果合同沒有規定受益年限，法律也沒有規定有效年限的，攤銷年限不應超過10年。
長期待攤費用
不含開辦費
包括開辦費
應付職工薪酬
為獲得職工提供服務而應付給職工的各種形式的報酬以及其他相關支出並進行詳細規範
通過應付工資、應付福利費等核算，未規範非貨幣性薪酬及其他職工薪酬的核算
長期借款
小企業為購建固定資產在竣工決算前發生的借款費用，應當計入固定資產的成本
為購建固定資產而發生的專門借款，在滿足借款費用開始資本化的條件時至購建的固定資產達到預定可使用狀態前發生的借款費用，應計入固定資產成本
資本公積
僅核算資本（股本）溢價
包括四個明細科目：資本溢價、接受捐贈非現金資產準備、外幣資本折算差額、其他資本公積
盈余公積
法定公積金和任意公積金
法定盈余公積、任意盈余公積、法定公益金