南昌大學第壹附屬醫院創建於1939，前身為中正醫學院附屬醫院。解放後成為第六軍醫大學173醫院江西醫學院第壹附屬醫院，1958更名。之後，醫院的名字改了很多次。2005年江西醫學院與南昌大學合並後，更名為南昌大學第壹附屬醫院。
在科學研究、學科建設和人才隊伍建設方面，是全省唯壹壹所獲得三項國家發明獎和國家863計劃項目的醫院。自2007年以來，研究經費連續兩年超過654.38+00萬元，三級學科博士點9個，碩士點28個，國家內鏡實訓基地4個，省級重點(龍頭)學科654.38+02個，研究所5個。實驗室5個，其中省重點實驗室1個。
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