目前，全國市長培訓學院主要開展三個班:全國市長研究班、市長專題研究班、國外專題研究班。根據市長需要，有計劃地分期分批舉辦各類研究班。在努力辦好全國市長研究班、專題研究班的同時，受地方政府等部門委托，還協助地方政府舉辦了城鄉規劃建設管理領導幹部培訓班，培訓了3000多名城市領導幹部。同時，城市規劃、建設和管理方面的專家咨詢了40多個城市。此外，積極探索擴大培訓範圍，加強市長和領導鏈的專業能力培訓，使市長培訓發揮更大作用。目前，“城鄉規劃縣長專題研討班”和“大型工礦區企業負責人規劃建設管理專題研討班”已列入市長培訓工作。在京外建立沈陽建築大學國家級市長培訓教學基地，形成培訓總部與基地建設相結合的模式。
教學內容緊緊圍繞黨和政府關於城鄉發展的方針政策和城鄉規劃建設管理中的熱點難點問題，組織開展城鄉規劃建設管理等相關專業知識的培訓教學，開展城鄉工作經驗交流和問題對策研究，設計開發培訓課程。目前已開發市長培訓班130余期。教學形式以課堂教學、案例教學、互動教學、研究型教學為主，並安排相應的教學檢查和研究。此外，在內聯網上建立市長研究班主頁，為學習、交流和研究提供電子平臺。