1，不孕不育門診。省婦幼門診四樓和南方醫科大學分院三樓兩個診室，為所有不孕不育夫婦提供婦科、男科、超聲科醫生、遺傳咨詢師等各類診療服務，提供各類綜合檢查、超聲、會診、教育、咨詢服務。
2、試管嬰兒與輔助生殖技術中心。位於南醫大分校四樓，擁有寬敞舒適的試管嬰兒手術室和現代化的胚胎實驗室，配備了經驗豐富的醫療團隊和技術嫻熟的胚胎專家，實施各種試管嬰兒技術，包括丈夫精子人工授精(IUI-AIH)，捐獻者精子人工授精(IUI-AID)，包括卵細胞漿內單精子註射(ICSI)，卵子精子和胚胎冷凍，睪丸和附睪穿刺，等等。3、不孕癥內鏡診療中心。位於省婦幼三號樓五樓生殖中心，擁有先進的腹腔鏡、宮腔鏡手術技術和設備，為女性不孕癥提供專業的內鏡診療，適用於不明原因不孕癥、輕度子宮內膜異位癥、輕度盆腔原因患者。
4、生殖中心病房。位於省婦幼三號樓四樓，* * *擁有32張床位，擁有先進完善的病房設施和專業服務，治療需要住院治療的不孕夫婦，如腹腔鏡手術、先兆流產、中重度卵巢過度刺激綜合征、多胎減孕手術等。
5.微刺激中心。位於省婦幼生殖中心的試管嬰兒微刺激與自然周期方案是該學科的特色項目，在國內具有領先地位。目前主要針對卵巢功能障礙患者和不能或不願刺激卵巢的患者。
6、生殖醫學基因檢測中心。位於南醫大分院二樓，負責遺傳病的細胞和分子檢測，擁有專業的遺傳顧問和實驗室技術團隊。
7.特殊需要患者中心。位於南醫大分院五樓，為有特殊需求的患者提供高端服務和診療。
8.生殖醫學實驗室。是生殖醫學國家重點實驗室的臨床基地，承擔多項國家、省、部級科研項目的研究任務，在全省範圍內組織多中心研究項目，擁有200多㎡的實驗室研究場地和設備條件，以及優秀的科技團隊，與多位國際知名科學家合作，為各種生殖醫學基礎和臨床研究項目提供實驗條件。
生殖醫學技術項目全面，各項技術指標進入全國先進行列。2014年，體外受精取卵周期數5 752個，同比上升20.64%，移植周期數6 093個，同比上升24.93%，人工授精周期數3 014個，同比上升16.82%。江蘇省婦幼保健院婦科成立於1957，是南京醫科大學臨床醫學院二級學科，南京醫科大學婦產科碩士學位授予點，衛生部首批國家臨床重點專科建設項目單位，衛生部首批四級婦科內鏡培訓基地，衛生部住院醫師規範化培訓基地， 衛生部宮頸癌預防及癌前病變規範化診療示範基地和國家臨床藥物驗證機構。 婦科床位83張，本科設有婦科腫瘤、婦科微創治療、內分泌治療、盆底重建、計劃生育等特色專業治療組，擁有壹批在國內、省內享有盛譽的專家。
婦科常規開展各種婦科腫瘤及常見婦科疾病的腹腔鏡、宮腔鏡微創治療，開展四級婦科內鏡手術。婦科惡性腫瘤、重度子宮內膜異位癥、盆腔器官脫垂、生殖道畸形的矯治技術是婦科的特色技術。在婦科腫瘤規範化診療和四級婦科內鏡應用方面積累了豐富的臨床經驗，承擔了省內疑難婦科疾病和復雜手術的指導和會診工作。婦科惡性腫瘤的腹、腹腔鏡手術達到國內領先水平，省內較早開展腹腔鏡系統腹主動脈旁、盆腔淋巴結清掃術；腹腔鏡下宮頸癌根治術:子宮內膜癌和卵巢癌的腹腔鏡分期手術和外陰癌的腹腔鏡腹股溝淋巴結清掃術。腹腔鏡腹膜外淋巴結清掃術達到國際領先水平。在相關基礎和臨床研究方面，承擔了多項國家級和省級項目，並多次獲獎。江蘇省婦幼保健院產科成立於1957。是江蘇最早的獨立產科。是國家臨床重點專科、科教興衛省級重點學科、省級臨床重點專科、南京醫科大學臨床婦產科碩士和博士學位授予點、衛生部住院醫師規範化培訓基地、衛生部產前診斷(篩查)專家組成員、江蘇省首批產前診斷(篩查)技術服務機構。
產科作為省內最大的綜合性三級甲等醫院的三級學科，具有強大的內、外、兒科支撐。有普通門診、高危門診、產前基因咨詢門診、產科VIP門診；產房、宮內介入治療室、家庭候診室、特殊產房、綜合產房；產科病房、產科重癥監護室(MICU)、產科特別病房、產後康復中心；特殊嬰兒室、新生兒遊泳療法訓練中心、新生兒撫觸室、新生兒聽力篩查室、新生兒疾病篩查室；產科超聲室、產科實驗室、產前診斷中心等。現有床位92張，臨床診療內容全面，具有產科急診、妊娠高血壓綜合征管理、早產防治、高危新生兒管理、胎兒醫學等特色。每年的交付總數約為4000次。雖然危重孕產婦占三分之壹，但剖宮產率、孕產婦和圍產兒死亡率明顯低於全國和全省平均水平。
產科產前診斷中心是婦幼保健省級重點學科。1980建立產前診斷實驗室。2004年成為江蘇省首批產前診斷(篩查)技術服務機構，提供遺傳咨詢、醫學影像、生化免疫、細胞遺傳學、分子遺傳學等多種產前診斷服務，成立了胎兒醫學集團。目前擁有約200㎡的實驗室，配備約700萬元的儀器設備。
江蘇省婦幼保健院兒科是江蘇省“十壹五”重點學科兒科的重要組成部分。是南京醫科大學博士、碩士學位授予點和博士後流動站。兒科病房占地2300㎡，分為兒童壹、兒童二、新生兒科三個單元，開放床位90張。下設新生兒、血液腫瘤、感染(呼吸與消化)、內分泌、心血管、風濕免疫六個子專業。其中，新生兒科為省婦幼保健重點學科，兒童內分泌與感染專業為國家藥物臨床試驗基地。
兒科有以下專業技術水平較強的團隊:
1，新生兒專業團隊:近年來，新生兒疾病的診治取得了很大進展，尤其是新生兒危重疾病的治療，積累了豐富的臨床經驗。每年收治新生兒患者1200余例，其中早產兒占65%以上，極低出生體重危重兒占25-30%以上。近年來，通過多學科合作，成功救治胎齡25+周、出生體重僅790g的早產兒，救治雙側胸腔大量乳糜胸、先天性膈疝、兇險性前置胎盤、高危妊娠合並嚴重並發癥的高危兒。危重新生兒救治技術水平達到省內先進水平。
2.小兒血液腫瘤專業團隊:集臨床、科研、教學於壹體，具有壹流的實驗室檢測、診斷和治療技術，包括細胞形態學和細胞化學、細胞遺傳學和分子遺傳學、免疫學和分子生物學檢測技術。除了臨床檢測，我們還開展了各項科研工作，積極開展兒童白血病和惡性腫瘤的規範化治療和個體化治療。該專科目前是江蘇省新農合定點醫療機構，是江蘇省農村兒童重大疾病(兒童白血病)定點醫院的特色專科。適合全省各地白血病患兒在新農合政策下異地就醫。
3.小兒呼吸專業團隊:本專業專註於小兒呼吸系統疾病的臨床診斷、治療和預防，承擔該領域的科研和教學工作，研究小兒呼吸系統的免疫和過敏反應。可檢查兒童免疫學、過敏、病因，重點是兒童慢性咳嗽、反復喘息、反復呼吸道感染的診治；兒童哮喘的標準化診斷、治療和管理；兒童疑難重癥肺部疾病的診斷和治療。
4.兒童內分泌專業團隊:是最早擁有國家藥物臨床試驗資質的團隊。具有豐富的臨床經驗，在南京地區率先診治了因身材矮小、性早熟、青春期延遲、肥胖、消瘦、糖尿病、甲狀腺疾病、甲狀旁腺功能異常等引起的低鈣血癥、高鈣血癥、低磷血癥、骨質疏松、腎上腺皮質增生、腎上腺皮質功能減退、代謝性佝僂病、低血糖等內分泌、遺傳、代謝性疾病。
從2009年開始，開設了兒童慢性咳喘、內分泌疾病、心血管疾病、風濕免疫、新生兒疾病、白血病、淋巴瘤等兒科門診以及高級專家門診，同時開設了365天專家門診和夜間專家門診。
江蘇省婦幼保健院乳腺疾病科是江蘇省唯壹的省級乳腺疾病診療中心。中心診療模式是根據現代臨床醫學發展理念和國際先進診療流程構建的。近年來不僅在我省乳腺疾病的診療方面處於領先水平，在國內也名列前茅。
該中心主任、博士生導師王水教授是我國著名的乳腺疾病診治專家。作為主要研究人員之壹，參與了衛生部乳腺癌診療的多項重大臨床研究課題，是衛生部乳腺癌診療規範制定的專家之壹。
該中心堅持“以患者為中心，以疾病為基礎，多學科合作，規範診療，個體化治療”的發展理念。在乳腺外科的前提下，整合了腫瘤、放療、影像、病理、整形、康復、心理等部分資源，組建了高學歷、高水平的多學科合作團隊。根據診療特點，我們設立了影像診斷、病理診斷、手術、化療、整形等專項小組，為患者提供個性化的優質服務。
該中心不僅擁有先進的建設理念和壹流的人才隊伍，還擁有舒適的醫療環境和先進完備的診療設備。目前有兩個獨立的乳腺疾病專科病房，在編床位70余張，其中腫瘤、放療、整形外科乳腺癌治療床位100張。中心配備了高性能乳腺彩超診斷儀、高清數字鉬靶x光機、最新的3.0T乳腺磁共振振動器、省內唯壹專用於乳腺鈣化定位和微創手術的臥式鉬靶活檢床。此外，它還擁有McMoton和Encor微創旋切系統、乳腺分子影像系統和超細乳腺纖維鏡。為乳腺疾病的診治，尤其是乳腺癌的早期診斷和綜合治療提供了堅實的保障。
江蘇省婦幼保健院小兒心胸外科是江蘇省婦幼保健重點學科建設單位。是江蘇省婦幼保健系統唯壹能獨立開展各種先天性心臟病診療的專業團隊，是江蘇省首家獲得農村合作醫療定點資格的單位。該科依托江蘇省婦幼保健院，與產科、新生兒科、兒童保健科密切合作，為先天性心臟病患兒提供最及時、最便捷的醫療救助。該部門整合了兒童心臟病學、外科、心臟重癥監護病房(CICU)、兒童心肺轉流和心臟超聲。通過醫療資源的優化配置，圍繞先天性心臟病的疾病特點，構建了兒童心臟專科多學科融合的先進管理模式，從而實現了先天性兒童診療的“綠色快速通道”。
小兒心胸外科現有普通床位23張，重癥監護床位8張，配備新型人工心肺轉流機、恒頻高頻呼吸機、多參數多功能心電監護儀、多功能新生兒放射臺及先進培養箱、床旁超聲機、彩色超聲心動圖機、心電圖機、床旁x光機、起搏器、輸液泵、血氣分析儀、纖維支氣管鏡、冷卻水毯、百級層流手術室等先進診療設備。科室常規單純性先天性心臟病手術成功率保持在100%，重癥復雜先天性心臟病手術成功率達到國際水平，手術總體成功率達到98.5%以上。手術不受年齡、體重限制，視患者病情決定手術時機，制定個性化手術方案。該科常規開展漏鬥胸、雞胸、胸壁腫塊及腫瘤、食管閉鎖、食管狹窄、食管裂孔疝、氣胸、早晚期膿胸、乳糜胸、肺良惡性腫瘤、新生兒膈疝、膈肌腫脹等普外科手術。手術創傷小，手術效果確切。婦女保健科是江蘇省婦幼保健重點學科。是南京醫科大學婦產科碩士生、博士生，江蘇省預防醫學會婦女保健專業委員會，江蘇省婦幼保健協會婦女保健分會主任委員單位。近年來，該科先後被批準為“中國婦女盆底功能障礙預防項目質量控制中心”、“江蘇省婦女健康與更年期保健示範基地”、“婦科內分泌與婦科常見病培訓基地”、“中法盆底功能障礙診療技術合作中心”。
學科承擔全省婦女保健服務相關新技術的技術監督、技術培訓、引進和推廣，開展女孩保健、青少年保健、孕前保健、圍產期保健、生殖保健、更年期保健、婦女心理保健、婦女營養等婦女全生命周期的各類保健服務。尤其擅長女性盆底功能障礙、婦科內分泌疾病、圍絕經期綜合征、絕經後骨質疏松癥的保健治療，並開展相關的臨床研究和教學。目前承擔國家級、部級、省級科研項目多項，發表論文100余篇，其中30余篇被SCI收錄；獲得江蘇省政府、南京市科技進步二等獎1，江蘇省婦幼保健新技術引進獎壹等獎。兒童保健科成立於2005年，是江蘇省婦幼保健重點學科，南京醫科大學兒科學碩士、博士學位授予點，江蘇省預防醫學會兒童保健專業委員會主任委員單位，江蘇省兒童保健技術指導中心。負責全省兒童健康專業人員的技術培訓、繼續教育和技術指導，參與制定國家兒童健康相關技術規範和全省兒童健康相關技術操作規範。學科下設兒童生長發育、兒童營養、兒童神經心理發育、兒童眼保健、兒童聽力保健、兒童早期發育、兒童康復等子專業，為兒童提供全方位的健康保健服務。兒童保健開設兒童生長發育門診和兒童營養門診，提供兒童骨齡評估、25-羥基維生素D測定、骨強度測定、髖關節發育篩查、微量元素檢查、血鉛測定等項目；設立兒童心理行為門診，提供兒童發育評價和智力測驗、氣質評價、行為評價、情緒評價、感覺統合能力評價、語言評價、註意力測驗和訓練；開設嬰幼兒早期幹預門診，提供嬰幼兒發育評估、肌力和肌張力評估、智力護理訓練、腦電生物反饋訓練等。開設兒童眼保健門診和聽力保健門診，開展兒童早期視力和眼病篩查，弱視、斜視、近視的診治，兒童聽力篩查和聽力異常的診治。兒童生長發育與兒童眼保健專業成為國家婦幼保健專業建設示範基地。