使用臟腑穴位進行治療時，所選穴位與針灸所選穴位基本相同，不離開十二經脈、齊靜八脈等經絡穴位。不同的是，臟腑穴位治療的關鍵部位在腹部。因為腹部是許多重要經絡循環匯聚的地方，直接作用於腹部，對臟腑經絡有特殊的調節和促進作用。值得註意的是，針灸是通過針灸來治療的，而臟腑的穴位是由醫者通過手或“指功”作用於患者的經絡穴位來治療的。
2疾病的診斷和治療特點
2.1醫武結合，懂“理”與辨證，精辟表述，祛邪不傷正。
針灸臟腑診斷和治療疾病的特點是醫與藥相結合。因此，需要深入理解醫學理論，在醫學理論的正確指導下，根據不同的病因病機進行辨證施治。只有在“理”的前提下，才能有效辨證；只有在辨證論治的基礎上，才能確立有效的治療原則和方法，從而運用“補虛”、“瀉實”、“理氣”等多種方法來辨病，辨證施治。同時要有過硬的武功。只有內功深厚，醫武結合，才能表現的淋漓盡致，達到療效。
醫武結合是以“功德”為基礎的，歷代聖賢都非常重視自身武功的修煉。學習這種“技巧”的人，壹定要按照傳統的方法去練習、去實踐，做到“明力後的班神”(即在知道“力”的基本方法後，能壹步步提高，達到靈活的程度)，才能得心應手，才能在診療過程中理解指感，掌握“力”等力的變化
2.2病前預防，病後預防，整體治療。
古人雲，上班就“治未病”。也就是說，聰明的醫生不是在疾病已經成為疾病的時候去治療，而是在疾病還沒有發病之前去預防，或者在疾病已經發病的時候去阻止疾病的傳播，比如“見肝之病，知肝傳脾，先健脾。”
人體是壹個有機整體，五臟六腑和四肢通過經絡有機聯系在壹起。所以針灸臟腑也是講究整體治療的，不是治療頭痛、腳痛，而是從整體出發，進行綜合治療。由於當前人們不良的生活和飲食習慣，以及高效快速的生活節奏，人群中的“亞健康狀態”越來越嚴重，甚至出現壹些不良癥狀。如果不治療，不治療，必然會導致疾病。根據其原理，針刺臟腑不僅可以緩解自身不適的某些癥狀，還可以通過調節臟腑氣機、平衡陰陽、增強臟腑功能來調動人體潛能、提高免疫力、預防疾病。臟腑穴位常被用來調節人體，能使人保持旺盛的精力和強健的體魄，延年益壽。
2.3求病根是臟腑腧穴診治疾病的壹個突出特點。
《蘇文·陰陽應象大論》說:“陰勝則陽病，陽勝則陰病”。臟腑陰陽虛弱會導致陰損陽損陰損。所以疾病的本質是臟腑陰陽失調的結果。臟腑陰陽壹旦被破壞，必然影響臟腑功能，導致臟腑氣機運化紊亂，出現壹些病理變化。所以針灸臟腑，很重視調節臟腑的氣含量，做到“輕者清則升，重者濁則降”。通過調節臟腑之氣，平衡陰陽，恢復臟腑功能。臟腑的陰陽平衡取決於“腎陰”和“腎陽”。因為腎主“藏精藏氣”，是臟腑陰之本，生命之源，故稱“先天之本”。然而，隱藏的本質不僅是從自然中繼承的，更重要的是，它是從水谷的內臟過剩的本質中繼承的。如果脾胃失衡，水谷無法支撐腎臟等臟腑，那麽人就像壹輛沒有油的車，開不動，所以才有“脾衰則亡”的說法。臟腑上的穴位用於加強脾胃功能。根據臟腑經絡的病機，結合辨證八綱，運用“調”、“補”、“瀉”等方法，損盈補虛，從根本上調整人體陰陽平衡，使之“陰為秘，神為治”，真正體現了“治必以精”的思想。
病歷舉例:患者王。4/5的胃癌患者行胃切除術。2003年6月兩次化療後，正氣極度虛弱，麥片4天不進，嘔吐頻繁。喝完水，家裏人邀請其余人來診治。診斷為脾胃功能受損，臟腑氣機失調，中焦受阻，濁氣上沖。故用“降逆止嘔”法，應用排濁扶正法，即先開中焦之門，點按“蘭門穴”。此穴是針灸臟腑的壹個特殊而重要的穴位。取臍上1.5寸處的穴位，按壓近2分鐘，再用泄法，使上焦濁氣減少。其次，輕調、輕補李穴，以補中氣。然後點氣海穴，先泄，再微調，促進陽氣上升，保護正氣。治療15分鐘止嘔。然後“放”脈(即用雙手拇指和食指操作“放”脈)，進壹步溝通上下焦，使全身運行順暢。然後點章門、兩門、石關，最後點後面的穴位。經過1小時的治療，患者感覺輕松，饑腸轆轆，告訴他吃完壹碗小米粥不吐，感覺不錯。怕它運輸功能弱，治療了半個小時幫它運輸。從那以後，我每頓飯都能吃，飯量也逐漸增加。經過壹段時間的治療，我的身體恢復得很好。之後在第三次和第四次化療時，沒有再出現嘔吐癥狀。
3臟腑穴位可謂“綠色療法”
臟腑穴位不需要針或藥物，而是通過辨證論治，通過醫者深厚的內功，用雙手或手指作用於患者的經絡穴位，用“調”、“補”、“排”、“動”、“扣”、“推”、“壓”、“放”等方法來調節臟腑的氣含量，以損實補虛。這種方法無創傷、無痛苦、無副作用，具有醫療保健價值，堪稱“綠色療法”。
在治療過程中，患者在舒適放松的狀態下接受治療。治療後患者會感到放松和舒適。處理時間壹般在1小時左右。也就是說，幫助患者運動了1小時。如果患者脾胃運化虛弱，可以助運化。古人雲“抖則除谷氣”。而古琦的消除可以轉化為潛移默化的水谷，從而使腎氣得以充盈，提高對疾病的抵抗力。臟腑配穴法將特殊的配穴方法應用於腹部和背部穴位，直接調節臟腑功能，可治療五臟病證。從現代醫學的角度來看，臟腑點穴法在促進人體血液循環、激活體內細胞、發揮人體潛能、增強免疫力等方面具有良好的療效和長期療效。