福建九龍谷國家森林公園創建於2002年，位於福建省莆田市城廂區常太鎮溪南村，距莆田市區僅32公裏，繞東圳水庫環庫公路，經常太枇杷第壹村—洋邊村，沿途花果飄香，風光旖旎，素有莆田“後花園”美稱。
2003年，在廈門國際旅遊節上，民營企業家黃金華先生與福建省莆田市城廂區人民政府正式簽訂了1.27億元旅遊投資項目，在城廂區常太鎮與仙遊縣鐘山鎮交界的溪南村承包7.5平方公裏的山林經營權，經營期為47年，用於九龍谷的旅遊開發。為了適應旅遊業發展和滿足人們休閑度假的需要，同時更好地保護和開發利用九龍谷森林風景資源，由城廂區林業局牽頭，福建省莆田市常興虎堀山旅遊開發有限公司（現更名為福建省莆田市九龍谷綜合發展有限公司）承辦，主抓開發建設。10月，公園完成編制《虎堀山生態風景壹期工程環境影響評價報告書》，並邀請姚金杜高級工程師實地進行植物調查。經反復論證，正式提出建立莆田虎堀山森林公園的可行性研究報告。
2004年11月，公園被省林業廳批準為省級森林公園。為將建成符合國家級標準的森林公園。12月，莆田市常興虎堀山旅遊開發有限公司向城廂區人民政府申請成立“福建省莆田虎堀山森林公園管理處”。 12月27日，莆田虎堀山森林公園管理委員會成立，由分管副區長兼任委員會主任，下設的管委會辦公室為常設機構，隸屬區人民政府，機構級別定為副科級事業單位，財政全額撥款，編制核定為3名。辦公室負責督促虎堀山森林公園項目業主按森林公園規劃實施開發建設，負責管理森林公園及周邊地區的森林資源。
2005年11月30日，經省林業廳批準，同意將“莆田虎堀山森林公園”更名為“莆田九龍谷森林公園”，並同意《莆田九龍谷森林公園總體規劃》內容作為森林公園建設依據。此後，森林公園又增設了以座落於城廂區華亭鎮的龜山寺為中心的龜山寺景區。
經過五年的努力建設，2006年12月，九龍谷分別被國家林業局、國家旅遊局批準為“福建九龍谷國家森林公園”、“全國農業旅遊示範點”，並已成為“莆田市青少年科普基地”、“莆田市文學創作基地”、“莆田市教育攝影創作基地”、“省級水利觀光園”。
2008年9月，國家林業局準予九龍谷國家級森林公園改變經營範圍，將經營面積由林場許準[2006]928號批準的1526.49公頃變更為1091.5公頃。調整後森林公園由九龍谷、龜山寺和漈川三個風景區組成。
2009年9月成功完成了經營權轉讓，民營企業家許春生先生將斥巨資打造九龍谷AAAA級旅遊景區。9月至10月底，新業主已投資200萬元，其中：電路改造及變壓器擴容50萬元，接待設施及基礎設施完善150萬元。擬投資600萬元，其中：鋪設3公裏公路300萬元、修築4各水壩200萬元、裝修接待綜合樓100萬元、總體規劃及控制性規劃編制100萬元。2010年計劃投資3000萬元，進壹步完善公園設施，同時加大宣傳促銷力度，提升公園品位和形象。目前，公園年接待遊客約18萬人次。